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    適用于MGI SARS-CoV-2面板的CleanPlex

     更新時間:2020-06-05 點擊量:1214

    paragongenomics適用于MGI SARS-CoV-2面板的CleanPlex®

     

    該基于擴增子的SARS-CoV-2 NGS面板專為COVID19冠狀病毒研究和監(jiān)測而設(shè)計,可對負責(zé)COVID19大流行的新型SARS-CoV-2病毒進行完整的基因組測序。該面板專門針對MGI Tech的DNBSEQ平臺。其他版本可用于  Illumina測序平臺。 

    SKU:paragongenomics 918001

    類別:CleanPlex對于MGI,CleanPlex為MGI現(xiàn)成的使用面板,傳染病,產(chǎn)品,準備到使用NGS面板標(biāo)簽:靶富集,靶向測序,擴增子測序,多重PCR,下一代測序,定向重測序,NGS面板,NGS測定,PCR擴增子測序,SARS-CoV的-2 ,研究面板,COVID19,2019-nCoV,傳染性疾病監(jiān)測

    產(chǎn)品描述

    用于MGI SARS-CoV-2的CleanPlex®面板,用于通過MGI Tech的DNBSEQ平臺上的下一代測序(NGS)的基于擴增子的靶標(biāo)富集檢測,跟蹤和研究COVID19冠狀病毒

    Paragon Genomics設(shè)計了一個高度多重的靶標(biāo)富集板,覆蓋了SARS-CoV-2病毒的整個基因組(末端的92個堿基除外)。該小組能夠?qū)ω撠?zé)COVID19大流行的新型SARS-CoV-2病毒進行完整的基因組測序和流行病學(xué)研究。借助Paragon Genomics CleanPlex技術(shù),可在5小時內(nèi)將病毒的整個基因組從RNA擴增到序列就緒的文庫。該面板的兩個版本可用于兩個主要的測序平臺:Illumina和MGI。CleanPlex技術(shù)可輕松,靈活地對樣品進行測序,以確保對傳染病的監(jiān)測和研究。

     

    強調(diào)

    • 節(jié)省大量成本
      降低測序成本98%。許多散彈槍宏基因組測序方法所需的每個樣品僅需要0.2M讀數(shù),而  1000萬個讀數(shù)。
    • 目標(biāo)區(qū)域的高覆蓋率
      整個SARS-CoV-2基因組的覆蓋率達到99%
    • 靈敏檢測
      可以高置信度檢測多達1個拷貝,而RT-qPCR可以檢測3-5個拷貝(1)
    • 快速,簡化的工作流程
      使用快速的四步協(xié)議(包括RT步驟)以少的動手時間,只需5.5小時即可生成可測序的文庫。
    • 性能超群
      準備高質(zhì)量的NGS庫具有優(yōu)良的對目標(biāo)使用CleanPlex技術(shù),使高效利用測序讀取性能。CleanPlex專家組的準靶率通常比混合捕獲的小靶標(biāo)富集專家組的靶率高得多。

     

    CleanPlex SARS-CoV-2面板包含帶有RT組件的CleanPlex多重PCR引物和CleanPlex靶向庫試劑盒。CleanPlex索引PCR引物和CleanMag ®  磁珠單獨訂購?fù)瓿蓮妮斎隦NA工作流測序就緒NGS庫。

     

    儲存溫度

    儲存在-20°C。

     

    (1)Corman VM等。通過實時RT-PCR檢測(2019-nCoV)https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC6988269/

    僅供研究使用。不用于診斷過程。


    (左)使用含有SARS-CoV-2的N和S基因的質(zhì)粒,通過一個單一的工作流程進行檢測,顯示了低拷貝數(shù)下的檢測率。結(jié)果表明,檢出率為1.1份時為56%,當(dāng)存在2份以上時為100%。通過使用兩個池來覆蓋整個病毒基因組,預(yù)期靈敏度只會進一步提高。(右)對于檢測到的這些,該小組能夠平均捕獲10倍讀取深度范圍內(nèi)的所有靶標(biāo),以獲得2.8個病毒拷貝,類似地,除了一個靶標(biāo)外,所有靶標(biāo)均捕獲1.4個病毒拷貝。所有目標(biāo)也均勻分布在整個GC范圍內(nèi)。

     

    附加信息

    包裝尺寸(反應(yīng))

    8、96、384